inquirybg

ພັນທຸ ກຳ ຂອງປະຊາກອນທົ່ວ Genome ແລະການຕິດຕາມໂມເລກຸນຂອງການຕໍ່ຕ້ານຢາຂ້າແມງໄມ້ໃນຍຸງ Anopheles ໃນ Sebatkilo, Awash, Ethiopia

ນັບຕັ້ງແຕ່ການຄົ້ນພົບຂອງມັນຢູ່ໃນ Djibouti ໃນປີ 2012, ຍຸງ Anopheles stephensi ຂອງອາຊີໄດ້ແຜ່ລາມໄປທົ່ວ Horn ຂອງອາຟຣິກາ. ວັກຊີນທີ່ຮຸກຮານນີ້ຍັງສືບຕໍ່ແຜ່ຂະຫຍາຍໄປທົ່ວທະວີບ, ເປັນໄພຂົ່ມຂູ່ຮ້າຍແຮງຕໍ່ໂຄງການຄວບຄຸມພະຍາດໄຂ້ຍຸງ. ວິທີການຄວບຄຸມ vector, ລວມທັງຕາຫນ່າງທີ່ປິ່ນປົວດ້ວຍຢາຂ້າແມງໄມ້ແລະການສີດພົ່ນທີ່ຕົກຄ້າງໃນເຮືອນ, ໄດ້ຫຼຸດຜ່ອນພາລະຂອງພະຍາດໄຂ້ຍຸງຢ່າງຫຼວງຫຼາຍ. ແນວໃດກໍ່ຕາມ, ອັດຕາການແຜ່ລະບາດຂອງຍຸງທີ່ທົນທານຕໍ່ຢາຂ້າແມງໄມ້ທີ່ເພີ່ມຂຶ້ນ, ລວມທັງປະຊາກອນ Anopheles stephensi, ແມ່ນຂັດຂວາງຄວາມພະຍາຍາມໃນການກໍາຈັດພະຍາດໄຂ້ຍຸງຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງ. ຄວາມເຂົ້າໃຈກ່ຽວກັບໂຄງສ້າງປະຊາກອນ, ການໄຫຼວຽນຂອງເຊື້ອພະຍາດລະຫວ່າງປະຊາກອນ, ແລະການແຜ່ກະຈາຍຂອງການປ່ຽນແປງການຕໍ່ຕ້ານຢາຂ້າແມງໄມ້ແມ່ນມີຄວາມຈໍາເປັນເພື່ອນໍາພາຍຸດທະສາດການຄວບຄຸມພະຍາດໄຂ້ຍຸງທີ່ມີປະສິດທິພາບ.
ການປັບປຸງຄວາມເຂົ້າໃຈຂອງພວກເຮົາກ່ຽວກັບວິທີການ An. Stephensi ໄດ້ຮັບການສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນໃນ HOA ແມ່ນສໍາຄັນຕໍ່ການຄາດຄະເນການແຜ່ຂະຫຍາຍໄປສູ່ພື້ນທີ່ໃຫມ່. ພັນທຸ ກຳ ຂອງປະຊາກອນໄດ້ຖືກນໍາໃຊ້ຢ່າງກວ້າງຂວາງເພື່ອສຶກສາຊະນິດ vector ເພື່ອສ້າງຄວາມເຂົ້າໃຈກ່ຽວກັບໂຄງສ້າງປະຊາກອນ, ການຄັດເລືອກຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງ, ແລະການໄຫຼວຽນຂອງ gene18,19. ສໍາລັບ An. stephensi, ການສຶກສາໂຄງສ້າງປະຊາກອນແລະໂຄງສ້າງຂອງ genome ສາມາດຊ່ວຍອະທິບາຍເສັ້ນທາງການບຸກລຸກຂອງມັນແລະວິວັດທະນາການປັບຕົວໃດໆທີ່ອາດຈະເກີດຂື້ນນັບຕັ້ງແຕ່ການເກີດຂື້ນຂອງມັນ. ນອກເຫນືອໄປຈາກການໄຫຼວຽນຂອງ gene, ການຄັດເລືອກແມ່ນມີຄວາມສໍາຄັນໂດຍສະເພາະຍ້ອນວ່າມັນສາມາດກໍານົດ alleles ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການຕໍ່ຕ້ານຢາຂ້າແມງໄມ້ແລະສ່ອງແສງກ່ຽວກັບວິທີການ alleles ເຫຼົ່ານີ້ແຜ່ຂະຫຍາຍຜ່ານປະຊາກອນ 20.
ມາຮອດປະຈຸບັນ, ການທົດສອບເຄື່ອງໝາຍການຕ້ານທານຢາຂ້າແມງໄມ້ ແລະພັນທຸກໍາປະຊາກອນໃນຊະນິດທີ່ຮຸກຮານ Anopheles stephensi ໄດ້ຖືກຈຳກັດຢູ່ໃນພັນທຸກໍາຂອງຕົວເລືອກ. ການປະກົດຕົວຂອງຊະນິດພັນໃນອາຟຣິກາແມ່ນບໍ່ເຂົ້າໃຈຢ່າງສົມບູນ, ແຕ່ສົມມຸດຕິຖານອັນຫນຶ່ງແມ່ນວ່າມັນຖືກນໍາສະເຫນີໂດຍມະນຸດຫຼືສັດລ້ຽງ. ທິດສະດີອື່ນໆລວມມີການເຄື່ອນຍ້າຍທາງໄກໂດຍລົມ. ການໂດດດ່ຽວຂອງຊາວເອທິໂອເປຍທີ່ໃຊ້ໃນການສຶກສານີ້ໄດ້ຖືກເກັບກໍາຢູ່ໃນ Awash Sebat Kilo, ເມືອງທີ່ຕັ້ງຢູ່ຫ່າງຈາກ Addis Ababa 200 ກິໂລແມັດທາງທິດຕາເວັນອອກແລະຢູ່ໃນແລວເສດຖະກິດຕົ້ນຕໍຈາກ Addis Ababa ໄປ Djibouti. Awash Sebat Kilo ເປັນເຂດທີ່ມີການຕິດຕໍ່ຂອງພະຍາດໄຂ້ຍຸງສູງແລະມີປະຊາກອນຈໍານວນຫລາຍຂອງ Anopheles stephensi, ເຊິ່ງໄດ້ຖືກລາຍງານວ່າທົນທານຕໍ່ຢາຂ້າແມງໄມ້, ເຮັດໃຫ້ມັນເປັນສະຖານທີ່ສໍາຄັນສໍາລັບການສຶກສາພັນທຸກໍາຂອງປະຊາກອນ Anopheles stephensi8.
ການກາຍພັນຕ້ານຢາຂ້າແມງໄມ້ kdr L1014F ໄດ້ຖືກກວດພົບຢູ່ໃນຄວາມຖີ່ຕໍ່າໃນປະຊາກອນເອທິໂອເປຍ ແລະບໍ່ໄດ້ຖືກກວດພົບຢູ່ໃນຕົວຢ່າງພາກສະໜາມຂອງອິນເດຍ. ການກາຍພັນ kdr ນີ້ໃຫ້ຄວາມຕ້ານທານຕໍ່ pyrethroids ແລະ DDT ແລະໄດ້ຖືກກວດພົບໃນເມື່ອກ່ອນ. ປະຊາກອນ stephensi ເກັບກໍາໃນປະເທດອິນເດຍໃນ 2016 ແລະ Afghanistan ໃນ 2018.31,32 ເຖິງວ່າຈະມີຫຼັກຖານຂອງການຕໍ່ຕ້ານ pyrethroid ຢ່າງກວ້າງຂວາງໃນທັງສອງເມືອງ, ການກາຍພັນຂອງ kdr L1014F ບໍ່ໄດ້ຖືກກວດພົບຢູ່ໃນປະຊາກອນ Mangalore ແລະ Bangalore ທີ່ວິເຄາະຢູ່ທີ່ນີ້. ອັດຕາສ່ວນທີ່ຕໍ່າຂອງການໂດດດ່ຽວຂອງເອທິໂອເປຍທີ່ຖື SNP ນີ້ທີ່ເປັນ heterozygous ຊີ້ໃຫ້ເຫັນວ່າການກາຍພັນໄດ້ເກີດຂຶ້ນໃນບໍ່ດົນມານີ້ໃນປະຊາກອນນີ້. ນີ້ແມ່ນສະຫນັບສະຫນູນໂດຍການສຶກສາທີ່ຜ່ານມາໃນ Awash ທີ່ບໍ່ພົບເຫັນຫຼັກຖານຂອງການກາຍພັນຂອງ kdr ໃນຕົວຢ່າງທີ່ເກັບກໍາໃນປີກ່ອນການວິເຄາະນີ້.18 ພວກເຮົາໄດ້ກໍານົດການກາຍພັນຂອງ kdr L1014F ນີ້ໃນຄວາມຖີ່ຕ່ໍາໃນຊຸດຂອງຕົວຢ່າງຈາກພາກພື້ນດຽວກັນ / ປີໂດຍໃຊ້ວິທີການກວດຫາ amplicon.28 ເນື່ອງຈາກຄວາມຕ້ານທານຂອງ phenotyele ທັງຫມົດ phenotyele ຕ່ໍາ. ເຄື່ອງຫມາຍການຕໍ່ຕ້ານນີ້ແນະນໍາວ່າກົນໄກອື່ນໆນອກເຫນືອຈາກການດັດແປງສະຖານທີ່ເປົ້າຫມາຍແມ່ນຮັບຜິດຊອບຕໍ່ລັກສະນະທີ່ສັງເກດເຫັນນີ້.
ຂໍ້ຈໍາກັດຂອງການສຶກສານີ້ແມ່ນການຂາດຂໍ້ມູນ phenotypic ກ່ຽວກັບການຕອບສະຫນອງຢາຂ້າແມງໄມ້. ການສຶກສາເພີ່ມເຕີມທີ່ປະສົມປະສານການຈັດລໍາດັບ genome ທັງຫມົດ (WGS) ຫຼືການຈັດລໍາດັບ amplicon ເປົ້າຫມາຍໃນການປະສົມປະສານກັບ bioassays ຄວາມອ່ອນໄຫວແມ່ນຈໍາເປັນເພື່ອສືບສວນຜົນກະທົບຂອງການກາຍພັນເຫຼົ່ານີ້ຕໍ່ການຕອບໂຕ້ຢາຂ້າແມງໄມ້. ເຫຼົ່ານີ້ SNPs missense ໃຫມ່ທີ່ອາດຈະກ່ຽວຂ້ອງກັບການຕໍ່ຕ້ານຄວນຈະຖືກເປົ້າຫມາຍສໍາລັບການກວດສອບໂມເລກຸນທີ່ມີຄວາມໄວສູງເພື່ອສະຫນັບສະຫນູນການຕິດຕາມແລະອໍານວຍຄວາມສະດວກໃນການເຮັດວຽກເພື່ອເຂົ້າໃຈແລະກວດສອບກົນໄກທີ່ມີທ່າແຮງທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບ phenotypes ການຕໍ່ຕ້ານ.
ສະຫລຸບລວມແລ້ວ, ການສຶກສານີ້ໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈເລິກເຊິ່ງກ່ຽວກັບພັນທຸກໍາປະຊາກອນຂອງຍຸງ Anopheles ໃນທົ່ວທະວີບ. ການນຳໃຊ້ການວິເຄາະ genome sequencing (WGS) ໃຫ້ກັບກຸ່ມຕົວຢ່າງທີ່ໃຫຍ່ກວ່າໃນເຂດພູມສັນຖານຕ່າງໆ ຈະເປັນກຸນແຈສຳຄັນໃນການເຂົ້າໃຈການໄຫຼວຽນຂອງ gene ແລະການກຳນົດເຄື່ອງໝາຍຂອງການຕໍ່ຕ້ານຢາຂ້າແມງໄມ້. ຄວາມຮູ້ນີ້ຈະຊ່ວຍໃຫ້ເຈົ້າໜ້າທີ່ສາທາລະນະສຸກສາມາດຕັດສິນໃຈໄດ້ຢ່າງມີຂໍ້ມູນໃນການເຝົ້າລະວັງ vector ແລະການໃຊ້ຢາຂ້າແມງໄມ້.
ພວກ​ເຮົາ​ໄດ້​ນໍາ​ໃຊ້​ສອງ​ວິ​ທີ​ການ​ກວດ​ສອບ​ການ​ປ່ຽນ​ແປງ​ຈໍາ​ນວນ​ສໍາ​ເນົາ​ໃນ​ຊຸດ​ຂໍ້​ມູນ​ນີ້​. ທໍາອິດ, ພວກເຮົາໄດ້ນໍາໃຊ້ວິທີການທີ່ອີງໃສ່ການຄຸ້ມຄອງທີ່ສຸມໃສ່ການກໍານົດກຸ່ມ gene CYP ໃນ genome (ຕາຕະລາງເສີມ S5). ການປົກຫຸ້ມຂອງຕົວຢ່າງໄດ້ຖືກສະເລ່ຍໃນທົ່ວສະຖານທີ່ເກັບກໍາແລະແບ່ງອອກເປັນສີ່ກຸ່ມ: ເອທິໂອເປຍ, ຂົງເຂດອິນເດຍ, ອານານິຄົມອິນເດຍ, ແລະອານານິຄົມປາກີສະຖານ. ການຄຸ້ມຄອງສໍາລັບແຕ່ລະກຸ່ມໄດ້ຖືກປັບປຸງເປັນປົກກະຕິໂດຍໃຊ້ kernel smoothing ແລະຫຼັງຈາກນັ້ນວາງແຜນໂດຍອີງຕາມຄວາມເລິກການຄຸ້ມຄອງ genome ປານກາງສໍາລັບກຸ່ມນັ້ນ.


ເວລາປະກາດ: 23-06-2025