ສອບຖາມ

ການຟອສຟໍຣິເລຊັນກະຕຸ້ນຕົວຄວບຄຸມການຈະເລີນເຕີບໂຕຫຼັກ DELLA ໃນ Arabidopsis ໂດຍການສົ່ງເສີມການພົວພັນຂອງ histone H2A ກັບ chromatin.

ໂປຣຕີນ DELLA ແມ່ນຖືກອະນຸລັກໄວ້ເປັນຫຼັກຕົວຄວບຄຸມການເຕີບໂຕທີ່ມີບົດບາດສຳຄັນໃນການຄວບຄຸມການພັດທະນາຂອງພືດເພື່ອຕອບສະໜອງຕໍ່ສັນຍານພາຍໃນ ແລະ ສິ່ງແວດລ້ອມ. DELLA ເຮັດໜ້າທີ່ເປັນຕົວຄວບຄຸມການຖອດລະຫັດ ແລະ ຖືກຮັບສະໝັກໃຫ້ເປັນຕົວສົ່ງເສີມເປົ້າໝາຍໂດຍການຜູກມັດກັບປັດໄຈການຖອດລະຫັດ (TFs) ແລະ histone H2A ຜ່ານໂດເມນ GRAS ຂອງມັນ. ການສຶກສາທີ່ຜ່ານມາໄດ້ສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າຄວາມໝັ້ນຄົງຂອງ DELLA ຖືກຄວບຄຸມຫຼັງການແປໂດຍຜ່ານສອງກົນໄກຄື: polyubiquitination ທີ່ເກີດຈາກ phytohormone gibberellin, ເຊິ່ງນຳໄປສູ່ການເສື່ອມສະພາບຢ່າງໄວວາ, ແລະ ການປະສົມປະສານຂອງຕົວດັດແປງຄ້າຍຄື ubiquitin ຂະໜາດນ້ອຍ (SUMO) ເພື່ອເພີ່ມການສະສົມຂອງມັນ. ນອກຈາກນັ້ນ, ກິດຈະກຳຂອງ DELLA ຖືກຄວບຄຸມແບບໄດນາມິກໂດຍ glycosylations ສອງຢ່າງທີ່ແຕກຕ່າງກັນ: ການພົວພັນ DELLA-TF ແມ່ນໄດ້ຮັບການປັບປຸງໂດຍ O-fucosylation ແຕ່ຖືກຍັບຍັ້ງໂດຍການດັດແປງ N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) ທີ່ເຊື່ອມຕໍ່ກັບ O. ຢ່າງໃດກໍຕາມ, ບົດບາດຂອງການຟອສຟໍຣິເລຊັນຂອງ DELLA ຍັງບໍ່ຊັດເຈນ, ຍ້ອນວ່າການສຶກສາກ່ອນໜ້ານີ້ໄດ້ສະແດງໃຫ້ເຫັນຜົນໄດ້ຮັບທີ່ຂັດແຍ້ງກັນ, ຕັ້ງແຕ່ຜົນທີ່ສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າການຟອສຟໍຣິເລຊັນສົ່ງເສີມ ຫຼື ຫຼຸດຜ່ອນການເສື່ອມສະພາບຂອງ DELLA ຈົນເຖິງຜົນອື່ນໆທີ່ສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າການຟອສຟໍຣິເລຊັນບໍ່ມີຜົນກະທົບຕໍ່ຄວາມໝັ້ນຄົງຂອງມັນ. ໃນທີ່ນີ້, ພວກເຮົາລະບຸສະຖານທີ່ຟອສຟໍຣິເລຊັນໃນ REPRESSORga1-3(RGA, AtDELLA) ທີ່ບໍລິສຸດຈາກ Arabidopsis thaliana ໂດຍການວິເຄາະມວນສານ ແລະ ສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າການຟອສຟໍຣິເລຊັນຂອງສອງເພບໄທດ໌ RGA ຢູ່ໃນພາກພື້ນ PolyS ແລະ PolyS/T ສົ່ງເສີມການຜູກມັດ H2A ແລະ ເສີມຂະຫຍາຍກິດຈະກຳ RGA. ການພົວພັນຂອງ RGA ກັບໂປຣໂມເຕີເປົ້າໝາຍ. ສິ່ງທີ່ໜ້າສັງເກດແມ່ນການຟອສຟໍຣິເລຊັນບໍ່ມີຜົນກະທົບຕໍ່ການພົວພັນ RGA-TF ຫຼື ຄວາມໝັ້ນຄົງຂອງ RGA. ການສຶກສາຂອງພວກເຮົາເປີດເຜີຍກົນໄກໂມເລກຸນທີ່ການຟອສຟໍຣິເລຊັນກະຕຸ້ນກິດຈະກຳ DELLA.
ເພື່ອອະທິບາຍບົດບາດຂອງການຟອສຟໍຣິເລຊັນໃນການຄວບຄຸມໜ້າທີ່ຂອງ DELLA, ມັນເປັນສິ່ງສຳຄັນທີ່ຈະຕ້ອງລະບຸສະຖານທີ່ຟອສຟໍຣິເລຊັນຂອງ DELLA ໃນຮ່າງກາຍ ແລະ ປະຕິບັດການວິເຄາະໜ້າທີ່ໃນພືດ. ໂດຍການກັ່ນຕອງຄວາມສຳພັນຂອງສານສະກັດຈາກພືດ ແລະ ຕິດຕາມດ້ວຍການວິເຄາະ MS/MS, ພວກເຮົາໄດ້ລະບຸຟອສຟໍໄຊທ໌ຫຼາຍແຫ່ງໃນ RGA. ພາຍໃຕ້ເງື່ອນໄຂຂອງການຂາດ GA, ການຟອສຟໍຣິເລຊັນຂອງ RHA ເພີ່ມຂຶ້ນ, ແຕ່ການຟອສຟໍຣິເລຊັນບໍ່ມີຜົນກະທົບຕໍ່ຄວາມໝັ້ນຄົງຂອງມັນ. ສິ່ງສຳຄັນ, ການວິເຄາະ co-IP ແລະ ChIP-qPCR ໄດ້ເປີດເຜີຍວ່າການຟອສຟໍຣິເລຊັນຢູ່ພາກພື້ນ PolyS/T ຂອງ RGA ສົ່ງເສີມການພົວພັນກັບ H2A ແລະ ການພົວພັນກັບໂປຣໂມເຕີເປົ້າໝາຍ, ເປີດເຜີຍກົນໄກທີ່ການຟອສຟໍຣິເລຊັນກະຕຸ້ນໜ້າທີ່ຂອງ RGA.
RGA ຖືກຮັບສະໝັກໃຫ້ເປັນໂຄຣມາຕິນເປົ້າໝາຍຜ່ານການພົວພັນຂອງໂດເມນຍ່ອຍ LHR1 ກັບ TF ແລະຫຼັງຈາກນັ້ນຜູກມັດກັບ H2A ຜ່ານພາກພື້ນ PolyS/T ແລະໂດເມນຍ່ອຍ PFYRE ຂອງມັນ, ປະກອບເປັນສະລັບສັບຊ້ອນ H2A-RGA-TF ເພື່ອເຮັດໃຫ້ RGA ໝັ້ນຄົງ. ການຟອສຟໍຣິເລຊັນຂອງ Pep 2 ໃນພາກພື້ນ PolyS/T ລະຫວ່າງໂດເມນ DELLA ແລະໂດເມນ GRAS ໂດຍໄຄເນສທີ່ບໍ່ຮູ້ຈັກເສີມຂະຫຍາຍການຜູກມັດ RGA-H2A. ໂປຣຕີນກາຍພັນ rgam2A ລົບລ້າງການຟອສຟໍຣິເລຊັນ RGA ແລະຮັບຮອງເອົາຮູບແບບໂປຣຕີນທີ່ແຕກຕ່າງກັນເພື່ອແຊກແຊງການຜູກມັດ H2A. ສິ່ງນີ້ເຮັດໃຫ້ການພົວພັນ TF-rgam2A ຊົ່ວຄາວບໍ່ໝັ້ນຄົງ ແລະ ການແຍກຕົວຂອງ rgam2A ຈາກໂຄຣມາຕິນເປົ້າໝາຍບໍ່ໝັ້ນຄົງ. ຮູບນີ້ສະແດງໃຫ້ເຫັນພຽງແຕ່ການສະກັດກັ້ນການຖອດລະຫັດທີ່ໄກ່ເກ່ຍໂດຍ RGA ເທົ່ານັ້ນ. ຮູບແບບທີ່ຄ້າຍຄືກັນນີ້ສາມາດອະທິບາຍໄດ້ສຳລັບການກະຕຸ້ນການຖອດລະຫັດທີ່ໄກ່ເກ່ຍໂດຍ RGA, ຍົກເວັ້ນວ່າສະລັບສັບຊ້ອນ H2A-RGA-TF ຈະສົ່ງເສີມການຖອດລະຫັດຂອງ gene ເປົ້າໝາຍ ແລະ dephosphorylation ຂອງ rgam2A ຈະຫຼຸດຜ່ອນການຖອດລະຫັດ. ຮູບທີ່ຖືກດັດແປງຈາກ Huang et al.21.
ຂໍ້ມູນດ້ານປະລິມານທັງໝົດໄດ້ຖືກວິເຄາະທາງສະຖິຕິໂດຍໃຊ້ Excel, ແລະຄວາມແຕກຕ່າງທີ່ສຳຄັນໄດ້ຖືກກຳນົດໂດຍໃຊ້ການທົດສອບ t ຂອງນັກຮຽນ. ບໍ່ມີວິທີການທາງສະຖິຕິໃດໆທີ່ຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອກໍານົດຂະໜາດຕົວຢ່າງເບື້ອງຕົ້ນ. ບໍ່ມີຂໍ້ມູນໃດຖືກຍົກເວັ້ນຈາກການວິເຄາະ; ການທົດລອງບໍ່ໄດ້ຖືກສຸ່ມ; ນັກຄົ້ນຄວ້າບໍ່ໄດ້ເບິ່ງຂ້າມການແຈກຢາຍຂໍ້ມູນໃນລະຫວ່າງການທົດລອງ ແລະ ການປະເມີນຜົນ. ຂະໜາດຕົວຢ່າງໄດ້ຖືກລະບຸໄວ້ໃນຄໍາອະທິບາຍຮູບພາບ ແລະ ໄຟລ໌ຂໍ້ມູນແຫຼ່ງຂໍ້ມູນ.
ສຳລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບການອອກແບບການສຶກສາ, ເບິ່ງບົດຄັດຫຍໍ້ບົດລາຍງານຜົນງານທຳມະຊາດທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບບົດຄວາມນີ້.
ຂໍ້ມູນໂປຣຕີໂອມິກສ໌ຂອງມວນສານສະເປກໂຕຣເມຕຣີໄດ້ຖືກປະກອບສ່ວນໃຫ້ແກ່ກຸ່ມບໍລິສັດ ProteomeXchange ຜ່ານບ່ອນເກັບຂໍ້ມູນຄູ່ຮ່ວມງານ PRIDE66 ພ້ອມດ້ວຍຕົວລະບຸຊຸດຂໍ້ມູນ PXD046004. ຂໍ້ມູນອື່ນໆທັງໝົດທີ່ໄດ້ຮັບໃນລະຫວ່າງການສຶກສານີ້ແມ່ນນຳສະເໜີຢູ່ໃນຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມ, ໄຟລ໌ຂໍ້ມູນເສີມ, ແລະ ໄຟລ໌ຂໍ້ມູນດິບ. ແຫຼ່ງຂໍ້ມູນແມ່ນສະໜອງໃຫ້ສຳລັບບົດຄວາມນີ້.

 

ເວລາໂພສ: ພະຈິກ-08-2024